《Science》子刊:新加坡團隊開發新方法 利用數位PCR 3小時內測48個端粒長度

2020/08/27
《Science》子刊:新加坡團隊開發新方法 利用數位PCR 3小時內測48個端粒長度
近(21)日,新加坡國立大學,利用數位PCR技術,開發一種新穎、快速的端粒測定方法—單端粒絕對長度快速分析法(SATR),可在臨床環境中快速確定癌症和年齡相關疾病中的端粒酶異常,有助於臨床醫生更快的為

2020.08.26環球生技雜誌/記者 彭梓涵編譯

近(21)日,新加坡國立大學,利用數位PCR技術,開發一種新穎、快速的端粒測定方法—單端粒絕對長度快速分析法(SATR),可在臨床環境中快速確定癌症和年齡相關疾病中的端粒酶異常,有助於臨床醫生更快的為患者進行診斷與計畫治療對策。相關研究日前已發表在《Science Advances 》期刊上。

目前在診斷和確定端粒長度與數量異常上,標準方法是使用南方墨點法(Southern blot),而於需要大量的起始基因體DNA(至少1μg),且過程繁瑣,不適合作臨床應用。

新加坡國立大學健康創新與技術研究院(iHealthtech)助理教授Cheow Lih Feng帶領的研究小組開發了一種新穎的方法,可在3小時內,測量單個端粒的絕對端粒長度,且這種獨特方法可在小於1 ng的DNA中測量48個端粒長度。此外該方法可在廣泛的樣品中測試,且能測量到0.2至320 kb的端粒長度。

此方法是將單個端粒分子分配到微流道晶片中數千的奈米孔中,然後再透過數位PCR機器,進行單個端粒分子的即時聚合酶連鎖反應(PCR),每個奈米孔中PCR擴增動力學反應端粒重複數,與端粒分子長度有關。

接著再使用STAR分析,研究人員可以準確的確定癌細胞中端粒的機制,像是能檢測出患有替代性延長端粒癌細胞(ALT)的結締組織癌和神經膠質瘤患者,這些患者通常預後比較差,另外他們也發現,這些患者的癌細胞具有額外的端粒分子拷貝。

為了測試這項發明準確性,新加坡國立大學也與KK婦女兒童醫院(KKH)小兒外科Amos Loh博士合作,因為結締組織癌和神經膠質瘤等神經元腫瘤中,兒童的患病率更高,正是ALT研究最好的族群。

目前新加坡大學也對STAR測定法進行準確性與敏感性確效,證明可有效診斷兒童神經母細胞瘤的ALT狀況,有潛力作為此癌症的預後指標。

KKH小兒外科顧問Amos Loh博士表示,端粒異常如ALT最近已被鑑定為神經母細胞瘤的新危險標誌。由於具有端粒異常的神經母細胞瘤預後較差,因此這種新的端粒測量方法,現在可以更簡單,更快速地鑑定ALT。

資料來源: https://www.sciencedaily.com/releases/2020/08/200825110748.htm