美CDC串連產官學 啟動新冠病毒基因定序聯盟

2020/05/12
美CDC串連產官學 啟動新冠病毒基因定序聯盟
近日(美國時間5月4日),美國疾病管制暨預防中心(CDC)啟動了一個包含產官學的龐大聯盟SPHERES,其由11個聯邦機構,22個學術機構,22個州立公共衛生實驗室,13個非營利研究組織以及15個實驗

美CDC串連產官學 啟動新冠病毒基因定序聯盟(圖片來源:CDC官網)

2020.05.12 環球生技雜誌記者/李林璦 編譯

近日(美國時間5月4日),美國疾病管制暨預防中心(CDC)啟動了一個包含產官學的龐大聯盟SPHERES,其由11個聯邦機構,22個學術機構,22個州立公共衛生實驗室,13個非營利研究組織以及15個實驗室和體外診斷醫療器材(IVD)公司組成,將擴大新冠病毒(SARS-CoV-2)的基因定序,有助於追蹤病毒的傳播方式、調查疫情,並了解病毒的演變方式以找到治療方式。 

該聯盟的公司包含:亞培(Abbott Diagnostics)、基因定序大廠Illumina、Qiagen、IDbyDNA、生物梅里埃有限公司(bioMérieux)、Color Genomics、合成生物學公司Ginkgo Bioworks、賽默飛世爾(Thermo Fisher Scientific)、In-Q-Tel、One Codex、Oxford Nanopore Technologies、Pacific Biosciences、美國兩大實驗室龍頭Quest Diagnostics和LabCorp以及Google母公司Alphabet旗下生命科學公司Verily等大廠。 

此外,還包括美國食品暨藥物管理局(FDA)和美國國家衛生研究院(NIH),以及比爾及梅琳達·蓋茲基金會(Bill & Melinda Gates Foundation)、陳-祖克柏生物中心(Chan Zuckerberg Biohub)和其他非營利組織和協會,以及美國數所大學。

而SPHERES聯盟有八個核心目標,包含:

1.整合與協調這些基因定序實驗室其專業能力與知識。

2.確定需求與其優先順序,將聯邦機構、非政府機構與私營機構的資金和資源進行最有效的分配。

3.改善各機構與地區之間的基因體定序的協調性,提高整體基因定序網絡的彈性。

4.在新冠肺炎大流行期間,加速美國與全球間的數據共享,並建立分析的標準。

5.將高品質的病毒序列數據從臨床和公共衛生實驗室快速發佈到美國國家生物技術資訊中心(NCBI)和全球最大的流感及新型冠狀病毒數據平台(GISAID),以加快數據生成和共享。

6.提供美國的產官學共同平台,以共享實驗指南(Protocol)、方法與生物資訊學分析工具。

7.建立統一的數據/大數據標準,包含簡化申請數據庫的流程、樣本的優先順序標準以及符合隱私標準的規範。

8.致力與其他國家的基因定序和生物資訊的數據庫標準一致,並促進全球在公共衛生的領域共享數據與標準。

CDC表示,SARS-CoV-2的快速基因定序將有助於監測病毒的變化、追蹤接觸者,並為診斷和療法研發人員提供資訊。

參考資料:https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/spheres.html

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